細菌在空氣中是不能單獨存在的，常附在比它們大數倍的塵粒表面，所以空氣中懸浮的或沉降到地面上的細菌。實際上是帶菌的生物粒子，因而浮游菌與沉降菌的關系即是浮游的生物粒子與沉降的生物粒子之間的關系。盡管自然大氣中微粒的濃度隨時間、地點不同有所變化，但粒徑分布是大體相同的。因而，可以認為在無風自然大氣中，浮游菌與沉降菌有相關關系，可以利用沉降菌值推算浮游菌的濃度。但生物潔凈室內，帶菌粒子的粒徑分布不同于在自然大氣中的分布，又有送風氣流的影響，浮游菌與沉降菌的關系必然不同于自然大氣中的情形。

　　不同用途的生物潔凈室的內部狀況是有差別的，其浮游菌與沉降菌的關系不可能相一致。對于制藥生物潔凈車間，其生產特性不但使之區別于其它用途的生物潔凈室，而且生產不同類型藥物的潔凈車間，其工藝過程各不相同，所以不能沿用一般生物潔凈室浮游菌與沉降菌的關系來反映制藥生物潔凈車間內二者的關系。

　　選擇浮游菌采樣器對潔凈廠房做浮游菌和降沉菌的采樣實驗：

　　不同類型的生物潔凈制藥車間，其浮游菌濃度與沉降菌落數的關系與各自具體的生產工藝、氣流組織形式、換氣次數、人員情況等因素有關，且差異甚大，難以找出共同性的規律，《GMP設計規范》中二者控制指標的關系充分體現了這一點。

　　因而就一般意義講，由于浮游菌濃度與沉降菌落數關系不確定，制藥車間的沉降菌量只能說明其表面微生物的污染狀況；浮游菌量則反映車間內空氣中生物粒子的濃度。

　　要全面反映車間內微生物的污染程度，需同時檢測沉降菌和浮游菌兩項指標，所以對于食品廠、手術室、潔凈室等，對于空氣潔凈度檢測中需同時檢測浮游菌和沉降菌兩個指標。